Laborant, biologi

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: http://www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi Vi söker en driven och motiverad postdoktor för arbete med forskning och utveckling (R&D) vid Uppsala Genome Center (UGC), en enhet inom National Genomics Infrastructure (NGI) vid SciLifeLab i Uppsala. Vi erbjuder storskalig long-read-sekvensering (NGS) till användare inom svensk akademi, industri och till internationella användare. Verksamheten består av ett team av projektkoordinatorer, forskningsingenjörer och bioinformatiker. Årligen analyserar vi mer än 1500 prover och genererar över 20 Terabaser data åt våra användare. Mer information om verksamhet hos Uppsala Genome Center finns på: https://www.uu.se/en/research/uppsala-genome-centre. Arbetsuppgifter Dina ansvarsområden kommer att omfatta men inte vara begränsade till: • Att driva R&D-projekt relaterade till verksamheten vid Uppsala Genome Center • Utveckling och implementering av nya protokoll och applikationer • Bioinformatiska analyser av longread-sekvensdata • Utveckla och implementera dataverktyg och arbetsflöden för bioinformatiska analyser • Presentera data från utvecklingsprojekt vid interna och externa möten och konferenser • Sammanställa resultat och publicera vetenskapliga artiklar Kvalifikationskrav Doktorsexamen inom bioinformatik, bioteknik, molekylärbiologi, genetik eller relaterat område eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc. • Dokumenterad erfarenhet av bioinformatiska analyser av sekvensdata • Erfarenhet av att hantera, sammanställa och visualisera data • Goda kunskaper i bioinformatik inom genomik och storskalig sekvensering (NGS). • Dokumenterad erfarenhet av analys av sekvensdata med relevanta programmeringsspråk (t ex Python, R). • Kunskap om att arbeta i Linux-miljö och i HPC-system. • Dokumenterad erfarenhet av att sammanställa och publicera vetenskapliga artiklar inom närliggande ämnesområde • Förmåga att hantera och prioritera uppgifter effektivt. • Förmåga att snabbt lära nya färdigheter. • Förmåga att självständigt identifiera och lösa problem under dataanalys. • Mycket goda kunskaper i svenska och engelska, både muntligt och skriftligt. Vi söker en person som är utåtriktad, proaktiv, ansvarsfull, noggrann och bekväm med att arbeta både självständigt och i team. Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper såsom en positiv attityd till serviceinriktat arbete och god samarbetsförmåga. Önskvärt/meriterande i övrigt Utöver de kvalifikationer som anges ovan uppskattar vi tidigare erfarenhet inom ett eller flera av följande områden: • Erfarenhet av metodutveckling och utveckling av analysverktyg • Erfarenhet av molekylärbiologiskt arbete i laboratoriemiljö, gärna NGS-metoder. • God förståelse för hur preanalytiska och laboratoriemetoder kan påverka datakvaliteten. Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad i 3 år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Susanne Hellstedt Kerje, [email protected], Lars Feuk, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 15 augusti 2025, UFV-PA 2025/2151. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: http://www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi Arbetsbeskrivning Detta translationella projekt syftar till att förbättra förståelsen för hur tumörmikromiljön i kolorektal cancer (CRC) påverkar prognos och behandlingssvar. Studien använder toppmoderna metoder för multiplexerad in situ-cancerprofilering, i kombination med projektspecifika metoder för kvantifiering av fibroblast- och kärlkarakteristika. Studierna utförs med hjälp av en uppsättning kliniskt välkommenterade stora CRC-samlingar. Projektet är ett samarbete mellan grupperna professor Tobias Sjöblom, Uppsala universitet, professor Arne Östman, Karolinska Institutet och professor Pia Österlund, Karolinska Institutet/Helsingfors universitet. Kvalifikationskrav Kandidaten ska ha en doktorsexamen och minst 4 års erfarenhet av postdoktoralt arbete inom ett relevant område. Dokumenterad expertis inom multiplexfärgning och tillhörande digital bildanalys krävs. Önskvärt och/eller meriterande i övrigt Tidigare erfarenhet av kvantitativ profilering av tumörmikromiljö anses meriterande. Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad, 11 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Tobias Sjöblom, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 10 juli 2025, UFV-PA 2025/2208. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: http://www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi Arbetsuppgifter  Forskningsassistenten ska arbeta inom medicinsk forskning och utföra forskningsuppdrag och assistentuppgifter inom medicinsk cancerforskning. I detalj kommer forskningsassistenten att genomföra experimentell forskning där hjärnceller och hjärntumörceller kommer att studeras i cellkulturer och in vivo-modeller i syfte att studera tumörutveckling och nya behandlingar med adeno-associerade virus. Inom arbetet ingår cellodling och experimentella modeller, behandlingsstudier in vitro och in vivo, genetisk kloning, screening med CRISPR-teknik, immunfärgningar och genetisk och epigenetisk analys av material sekvenserat på singelcellsnivå. Efter hand kommer assistenten driva mer självständiga projekt. Viss administration och mindre undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna. Kvalifikationskrav Forskningsassistenten ska ha en masterexamen i biomedicin, medicin, biologi eller motsvarande. Sökande ska ha dokumenterad erfarenhet av in vivo-modeller och FELASA C certifikat (eller motsvarande) är ett krav. Sökande ska ha dokumenterad erfarenhet av studier kring hjärnans utveckling och arbete med cellodling av cancerceller. Önskvärt/meriterande i övrigt Erfarenhet av studier med barncancer eller barnhjärntumörer är meriterande. Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad, 12 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Fredrik Johansson Swartling, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 14 juli 2025, UFV-PA 2025/2132. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Vill du vara med och utveckla genetisk precisionsdiagnostik? Vi söker en till två bioinformatiker för att driva utveckling och underhåll av bioinformatiska analyser för avancerad genetisk diagnostik inom sjukvården. Tjänsterna är vikariat i samband med föräldraledighet. Observera att detta är en förkortad version av annonsen. För att se den fullständiga annonsen vänligen klicka på ”Ansök här” eller se Uppsala universitets hemsida: https://uu.se/jobb/  Arbetsuppgifter: Faciliteten söker en till två bioinformatiker på heltid för att delta i utvecklingen av analyser riktade mot cancer och ärftliga sjukdomar. Tjänsterna är vikariat på ett år i samband med föräldraledigheter. Arbetsuppgifterna definieras utifrån kompetens och intresse, men kommer att vara inriktade mot utveckling och underhåll av diagnostiska analyser vid olika cancersjukdomar eller ärftliga sjukdomar. Analyserna inkluderar helgenomsekvensering, helexomsekvensering, transkriptomsekvensering samt breda genpaneler för detektion av genetiska varianter som påverkar diagnos, prognos och behandling utifrån diagnosprov eller uppföljningsprov. Flera utvecklingsprojekt pågår som utnyttjar long-read sekvens teknologier (PacBio och ONT), medan nuvarande diagnostik i huvudsak görs med short-read data. Den sökande kommer att vara inblandad i kontinuerlig utvärdering, utveckling och automation av robusta bioinformatiska analyser för kliniskt bruk. En del av uppdraget kommer att omfatta arbete med effektiv datahantering, automation och visualisering för att skapa effektiva dataflöden och för att underlätta klinisk tolkning och rapportering. Arbetet utförs i nära samarbete med kliniskt verksam personal och i samverkan med Genomics Medicine Sweden (GMS). Vi ser även positivt på sökande som är intresserade av arbetsuppgifter som omfattar databashantering och mjukvaruutveckling eftersom vi kontinuerligt strävar efter att utveckla enhetens analyser, IT-infrastruktur och arbetssätt. Vår pipelineutveckling sker framförallt med Python och Snakemake och den sökande kommer i sitt arbete ha möjlighet att bidra till projektet Hydra genetics (https://github.com/hydra-genetics/hydra-genetics).   En särskilt viktig aspekt är samarbetet med anställda inom sjukvården och förmåga att utveckla analysmetoder för angelägna kliniska frågeställningar. Eftersom verksamheten hanterar känsliga kliniska data är frågor kring datasäkerhet viktiga. Klinisk genomik är ett nytt och intensivt forskningsområde och den anställde kommer att ha möjlighet att bidra till publicering och presentation av både tekniska och medicinska/biologiska resultat och metoder. De anställda kommer att jobba tillsammans med andra bioinformatiker, läkare, sjukhusgenetiker och molekylärbiologer inom vår facilitet och även i nationella och internationella samarbeten. Kvalifikationskrav: - Mastersexamen i ämne med anknytning till tjänsten t.ex. bioinformatik, bioteknik, datavetenskap eller motsvarande fält.  - Dokumenterad förmåga inom ett eller flera scriptspråk (t ex Python/Bash/Perl) - Erfarenhet av att arbeta med NGS i linuxmiljö på beräkningskluster - Kännedom om git, conda och pipelineverktyg som Snakemake eller Nextflow - Erfarenhet av containermjukvara, Apptainer (Singularity)/Docker/Podman  - Grundläggande kunskaper om databashantering - God förmåga att kommunicera på svenska och engelska Arbetet ställer stora krav på noggrannhet, initiativkraft, samarbetsförmåga och självständighet, så stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet. Önskvärt och/eller meriterande i övrigt Doktorsexamen inom bioinformatik, genetik eller liknande fält är meriterande. Vi ser gärna sökande med erfarenhet av att arbeta med long-read sekvenseringstekniker riktade mot cancergenetik, klinisk bioinformatik eller klinisk genomik. Speciellt tidigare erfarenheter av att implementera bioinformatiska analyser med fokus på CNV, translokationer/fusioner och/eller SV-detektion är meriterande, liksom erfarenhet av att interagera med klinisk laboratoriepersonal. Eftersom dokumentation mot Akademiska sjukhuset sker på svenska är god förmåga att uttrycka sig på svenska i både tal och skrift önskvärt. Efter en kvalitativ helhetsbedömning av kompetens och skicklighet kommer den sökande att väljas som bedöms ha de bästa förutsättningarna att genomföra och utveckla aktuella arbetsuppgifter samt bidra till att utveckla verksamheten. Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad vikariat, 12 månader med möjlighet till förlängning. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Malin Melin, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 12 augusti 2025, UFV-PA 2025/2133. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: http://www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi Vi söker en medarbetare till Uppsala Genome Center som är en del av National Genomics Infrastructure (NGI) vid SciLifeLab i Uppsala. Vi erbjuder storskalig long-read-sekvensering (NGS) till användare inom svensk akademi, industri och till internationella användare. Verksamheten består av ett team av projektkoordinatorer, forskningsingenjörer och bioinformatiker. Årligen analyserar vi mer än 1500 prover och genererar över 20 Terabaser data åt våra användare. Data hanteras och analyseras i ett dedikerat kluster utformat för hantering av känsliga data. Klustret (Miarka) är beläget på UPPMAX, men utöver detta används även lokala servrar. Mer information om verksamhet hos Uppsala Genome Centers finns på: https://www.uu.se/en/research/uppsala-genome-centre Arbetsuppgifter: Dina ansvarsområden kommer att omfatta men inte vara begränsade till: • Delta i arbete med förnyelse av prov och projekthanterings system, Laboratory Information Management System (LIMS). • Bioinformatiska analyser av sekvensdata i serviceprojekt. • Delta i projektplaneringsmöten med användare och bidra med expertis inom bioinformatiska frågor. • Utveckla och implementera dataverktyg/pipelines och arbetsflöden för bioinformatiska analyser och filhantering. • Upprätta, underhålla och validera intern dokumentation. • Samarbeta med personal vid Uppsala universitets IT-avdelning, UPPMAX och andra SciLifeLab-enheter. • Utbildning av användare och studenter i datatekniska tillämpningar. • Tekniskt stöd i utåtriktade aktiviteter såsom konferenser och seminarier. Kvalifikationskrav: • Universitetsexamen inom bioinformatik, molekylärbiologi, genetik eller relaterat område. • Flera års dokumenterad arbetslivserfarenhet inom bioinformatik. • Goda kunskaper i bioinformatik inom genomik och storskalig sekvensering (NGS). • Goda programmeringskunskaper i Python eller liknande programmeringsspråk. • Kunskap om att arbeta i Linux-miljö och i HPC-system. • Erfarenhet av Git. • Förmåga att hantera och prioritera uppgifter effektivt. • Förmåga att snabbt lära nya färdigheter. • Förmåga att självständigt identifiera och lösa problem under dataanalys. • Mycket goda kunskaper i svenska och engelska, både muntligt och skriftligt. Vi söker en person som är utåtriktad, proaktiv, ansvarsfull, noggrann och bekväm med att arbeta både självständigt och i team. Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper såsom en positiv attityd till serviceinriktat arbete och god samarbetsförmåga. Önskvärt och/eller meriterande i övrigt: Utöver de kvalifikationer som anges ovan uppskattar vi tidigare erfarenhet inom ett eller flera av följande områden: • Doktorsexamen i genomik, genetik eller liknande område, inklusive bioinformatiskt arbete. • Erfarenhet av arbete i en forskningsinriktad serviceanläggning. • God förståelse för hur preanalytiska och laboratoriemetoder kan påverka datakvaliteten. • God förståelse för informationssäkerhet och GDPR. Om anställningen Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Susanne Hellstedt Kerje, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 15 augusti 2025, UFV-PA 2025/2143. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och det teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: http://www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi Arbetsuppgifter: Personen kommer att arbeta självständigt inom utveckling av cancerdiagnostik och cancerläkemedel för elakartade hjärntumörer. I arbetsuppgifterna ingår utveckling av genetiska konstrukt för lentivirus och adeno-associerade virus, produktion av virus och nya genterapier på viruslab, avancerad mikroskopering och kvantifiering av fluorescenta signaler, cellodling av primära patientmaterial, utveckling och behandling av in vivo modeller, strålning och cytostatikabehandling. Personen kommer att ha ett särskilt ansvar över gruppens GMM-verksamhet för produktion av genterapier och virus. Inom arbetsuppgifter ingår att personen ska presentera resultat och forskningsdata på olika seminarier samt skrivande av vetenskapliga artiklar på engelska. Slutligen ingår även undervisning, specifikt handledning av doktorander och masterstudenter, ev. annan undervisning på masterprogram på institutionen samt administrativa uppgifter för beställningar av genetiska konstrukt och sekvenseringar i forskargruppen.  Kvalifikationskrav   Forskaren ska ha en PhD inom medicin, biomedicin, molekylär bioteknik (eller motsvarande) och ha genomgått åtminstone 2 års postdoktoral utbildning inom forskningsområdet elakartade hjärntumörer. Forskaren ska ha mångårig erfarenhet och utmärkta och dokumenterade kunskaper i neurovetenskap, om odling av olika celltyper från hjärnan, samt av in vivo modeller (där FELASA C-certifikat, eller motsvarande är ett krav). Forskaren ska ha dokumenterad praktisk erfarenhet av konstruktion och produktion av lentivirus och adeno-associerade virus samt goda kunskaper om bioinformatisk/genetisk datoranalys. Forskaren ska ha dokumenterad erfarenhet av handledning av studenter, vara särskilt bra på att arbeta i akademiska vetenskapliga team samt på att koordinera och att självständigt planera sitt arbete. Stor vikt läggs vid personens lämplighet.  Önskvärt/meriterande i övrigt Forskaren bör ha publicerat egna vetenskapliga artiklar i ämnesområdet där forskaren haft en framträdande roll, samt ha mycket goda kunskaper både av att skriva och tala engelska. Om anställningen  Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Fredrik Johansson Swartling, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 10 juli 2025, UFV-PA 2025/1732. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: http://www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi Arbetsbeskrivning: Genomföra immunhistokemiska och immunfluorescensbaserade analyser av vävnad från kolorektaltumörer. Annotering av vävnadsbaserade analyser. Sammanställning och analys av data från immunfärgningsbaserade vävnadsanalyser. Kravspecifikationen: Svensk eller utländsk läkarexamen. Svensk eller utländsk specialistutbildning i patologi motsvarande minst 3 år. Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad, 12 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Tobias Sjöblom, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 8 juli 2025, UFV-PA 2025/2105. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Observera att detta är en förkortad version av annonsen. För att se den fullständiga annonsen vänligen klicka på ”Ansök här” eller se Uppsala universitets hemsida: https://uu.se/jobb/ Projektbeskrivning: Att förstå sambandet mellan genetisk variation och fenotypisk variation är ett grundläggande mål inomgenombiologi och genomisk medicin. Under de senaste 15 åren har genombredsstudier (GWAS)identifierat många DNA-regioner som är kopplade till komplexa egenskaper hos människor.Översättningen till funktionell förståelse släpar efter, delvis eftersom över 95 % av de GWAS-identifierade lokuserna hos människor finns i icke-kodande, regulatoriska regioner av genomet, och detär komplext att identifiera orsaksgener och mekanismer. I detta projekt syftar vi till att förstå demolekylära mekanismerna bakom arters förmåga att anpassa sig till sin miljö. Sill är ett utmärkt systemför att studera sådana anpassningar. För det första befruktar sillen sina ägg externt, vilket utsätter dem förbetydande miljövariation under hela deras livscykel. För det andra finns det cirka 10¹² sill på jorden, somparar sig slumpmässigt. Därför bestäms allelfrekvenserna för genvarianter i olika lokalt anpassadesubpopulationer av naturligt urval, medan genetiskt brus (genetisk drift) spelar en mycket liten roll.GWAS på sill, utförda i Leif Anderssons laboratorium i Uppsala universitet, har identifierat över 100 genomiska regioner somstyr anpassning till skillnader i salthalt, temperatur, tidpunkt för reproduktion och ljusförhållanden. Tillskillnad från hos människor omfattar många associerade DNA-regioner hos sill enskilda basförändringari protein-kodande sekvenser som tydligt pekar ut sannolika orsakande varianter och gener. Finansierat avWallenbergstiftelsen och möjliggjort av en ny forskningsinfrastruktur byggd av BalticWaters Foundation,rekryterar vi nu en forskare som ska ingå i ett team som strävar efter att avslöja de molekyläramekanismer genom vilka vissa identifierade varianter påverkar arters anpassning. Forskaren kommer attfokusera på base editing och funktionella experiment i zebrafiskmodeller, och eventuellt även i sill.Under hela projektet kommer forskaren att samarbeta med experter inom evolutionär biologi och spatialtranskriptomik, som angriper utmaningen från kompletterande perspektiv. Arbetsbeskrivning: Forskaren kommer i första hand att studera molekylära mekanismer som tros ligga bakom arters anpassning genom att utveckla och använda zebrafiskmodeller. Arbetsuppgifter inkluderar: - Generera mutanter med hjälp av den senaste tekniken inom base editing och CRISPR/Cas9-metoder - Skapa transgena, fluorescerande reporterlinjer för potentiella orsaksgener - Använda in vivo-fluorescensmikroskopi för att visualisera effekter av varianter - Förbereda prover för vidare experiment och analyser, t.ex. spatial och/eller enkelcells-RNA-sekvensering samt andra -omikmetoder - Objektivt kvantifiera bilddata - Datamanagement, kvalitetskontroll och statistisk analys av data - Hålla sig uppdaterad om metodutveckling inom området och implementera viktiga framsteg - Skriva rapporter och presentera resultat för teamet och vid internationella möten - Sprida resultat genom manuskript för publicering i peer review-granskade tidskrifter. Kvalifikationer: Ansökningar tas emot från mycket motiverade kandidater med doktorsexamen i molekylärbiologi eller liknande, med minst tre års relevant forskningserfarenhet på postdoktoral nivå. Sökande måste ha dokumenterad och bred kompetens inom grundläggande molekylärbiologiska metoder. Dokumenterad erfarenhet av genomredigering i zebrafisk krävs. Sökande måste ha minst två års erfarenhet av att använda zebrafisk som försöksdjur. Erfarenhet av mikroinjektioner och skötsel av zebrafisk krävs. En framgångsrik kandidat ska vara mycket motiverad, organiserad, pålitlig och kunna arbeta både i team och självständigt. Utmärkt kommunikationsförmåga på engelska krävs, både muntligt och skriftligt. Meriter: Tidigare kunskap och erfarenhet av fluorescensmikroskopi, datamanagement och bildbaserade analyser är meriterande. Ansökan  En beskrivning av din relevanta forskningserfarenhet, kunskaper, färdigheter och personliga förmågor. En beskrivning av vad som intresserar dig med den här tjänsten. Ett CV/meritförteckning En lista över publikationer i peer review-granskade tidskrifter Kontaktuppgifter till minst två referenspersoner. Om tillgängligt kan även rekommendationsbrev bifogas. Om anställningen  Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Marcel den Hoed, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 15 augusti 2025, UFV-PA 2025/2072. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Observera att detta är en förkortad version av annonsen. För att se den fullständiga annonsen vänligen klicka på ”Ansök här” eller se Uppsala universitets hemsida: https://uu.se/jobb/ Projektbeskrivning: Att förstå sambandet mellan genetisk variation och fenotypisk variation är ett grundläggande mål inom genombiologi och genomisk medicin. Under de senaste 15 åren har genombredsstudier (GWAS) identifierat många DNA-regioner som är kopplade till komplexa egenskaper hos människor.  Översättning till funktionell förståelse ligger efter, delvis eftersom över 95% av de GWAS-identifierade loci hos människor finns i icke-kodande, regulatoriska regioner av genomet, och att identifiera orsaksgen och mekanismer är komplext. I detta projekt syftar vi till att förstå de molekylära mekanismerna bakom arters förmåga att anpassa sig till sin miljö. Sillen är ett utmärkt system för att studera sådana anpassningar. För det första befruktar sillen sina ägg externt, vilket utsätter dem för betydande miljövariation under hela deras livscykel. För det andra finns det cirka 10¹² sill på jorden, vilka parar sig slumpmässigt. Därför bestäms allelfrekvenserna för genvarianter i olika lokalt anpassade subpopulationer av naturligt urval, medan genetiskt brus (genetisk drift) spelar en mycket liten roll. GWAS på sill, utförda vid Leif Anderssons laboratorium i Uppsala universitet, har identifierat över 100 genomiska regioner som styr anpassning till skillnader i salthalt, temperatur, tidpunkt för reproduktion och ljusförhållanden. Till skillnad från hos människor omfattar många associerade DNA-regioner hos sill enskilda basförändringar i protein-kodande sekvenser som tydligt pekar ut sannolika orsakande varianter och gener. Finansierat av Wallenbergstiftelsen och möjliggjort av en ny forskningsinfrastruktur byggd av BalticWaters Foundation, rekryterar vi nu en postdoktor som ska ingå i ett team som strävar efter att avslöja de molekylära mekanismer genom vilka vissa identifierade varianter påverkar arters anpassning. Postdoktorn kommer att fokusera på base editing och funktionella experiment i zebrafiskmodeller, och eventuellt även i sill. Under hela projektet kommer postdoktorn att samarbeta med experter inom evolutionär biologi och spatial transkriptomik, som angriper utmaningen från kompletterande perspektiv.  Arbetsbeskrivning: Postdoktorn kommer i första hand att studera molekylära mekanismer som tros ligga bakom arters anpassning genom att utveckla och använda zebrafiskmodeller. Arbetsuppgifter inkluderar: - Generera mutanter med hjälp av den senaste tekniken inom base editing och CRISPR/Cas9-metoder - Skapa transgena, fluorescerande reporterlinjer för potentiella orsaksgener - Använda in vivo-fluorescensmikroskopi för att visualisera effekter av varianter - Förbereda prover för vidare experiment och analyser, t.ex. spatial och/eller enkelcells-RNA-sekvensering samt andra -omikmetoder - Objektivt kvantifiera bilddata - Datamanagement, kvalitetskontroll och statistisk analys av data - Hålla sig uppdaterad om metodutveckling inom området och implementera viktiga framsteg - Skriva rapporter och presentera resultat för teamet och vid internationella möten - Sprida resultat genom manuskript för publicering i peer review-granskade tidskrifter. Kvalifikationer: Ansökningar tas emot från mycket motiverade kandidater med doktorsexamen i molekylärbiologi eller motsvarande. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc. Sökande måste ha dokumenterad och bred kompetens inom grundläggande molekylärbiologiska metoder. Dokumenterad erfarenhet av genomredigering i zebrafisk krävs. Sökande måste ha minst två års erfarenhet av att använda zebrafisk som försöksdjur. Erfarenhet av mikroinjektioner och skötsel av zebrafisk krävs. En framgångsrik kandidat ska vara mycket motiverad, organiserad, pålitlig och kunna arbeta både i team och självständigt. Utmärkt kommunikationsförmåga på engelska krävs, både muntligt och skriftligt. Meriter: Tidigare kunskap och erfarenhet av fluorescensmikroskopi, datamanagement och bildbaserade analyser är meriterande. Ansökan ska innehålla: En beskrivning av din relevanta forskningserfarenhet, kunskaper, färdigheter och personliga förmågor. En beskrivning av vad som intresserar dig med den här tjänsten. Ett CV/meritförteckning  En lista över publikationer i peer review-granskade tidskrifter  En kopia av din doktorsexamen  Vänligen ange kontaktuppgifter till minst två referenspersoner. Om tillgängligt kan även rekommendationsbrev bifogas.  Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad i 2 år enligt centralt kollektivavtal med möjlighet till 1 års förlängning. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Marcel den Hoed, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 15 augusti 2025, UFV-PA 2025/2071. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och det teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: http://www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi Arbetsbeskrivning En Forskningassistantstjänst finns tillgänglig vid Girauds forskningsprojekt vid institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet. Vi söker en motiverad kandidat med intresse för att studera maligna pediatriska hjärntumörer, med fokus på peditriska höggradiggliom och diffusa mittlinjegliom (DMG). Kandidaten kommer att använda genomisk, transkriptomisk och epigenomisk profilering för att undersöka tumörutveckling i pediatriska patientprover och karakterisera resistensmekanismer mot flera standardbehandlingar och riktade terapier. Kandidaten kommer också bidra med sin singelcellanalys expertis i gruppen och bidra i multiomic analys av tumörer under drugscreening i en nationell klinisk studie. Kravspecifikation Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har • avlagt examen på avancerad nivå inom medicin, biomedicin, molekylärbiologi, farmaci, genetik eller bioteknologi • fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, gärna inom Master’s Programme in Precision Medicine • Kan motivera starka grund i singelcell analys med erfarenhet i sin masterprogram projekt. Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad, 12 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Géraldine Giraud, [email protected] Välkommen med din ansökan senast den 10 juli 2025, UFV-PA 2025/1870. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.