Bioinformatiker

Vill du arbeta i absolut framkant av den molekylära precisionsdiagnostiken? Vi söker en bioinformatiker till vårt tolkningsteam inom cancerområdet. Här får du en nyckelroll där din analys och tolkning direkt påverkar diagnostik och behandlingsbeslut för cancerpatienter. Du erbjuds Ett meningsfullt arbete där din insats gör direkt nytta i patientdiagnostiken.   En roll med goda utvecklingsmöjligheter och att över tid ta ett större ansvar.      Möjlighet att arbeta i ett tvärvetenskapligt team med flexibla arbetstider och hybridarbete.     Stöd för fortbildning och professionell utveckling i en inkluderande miljö på ett av världens främsta universitetssjukhus. Självklart får du också ta del av våra generella förmåner som Karolinska Universitetssjukhuset erbjuder dig. Om tjänsten Tjänsten är placerad vid Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), som är en del av Medicinsk diagnostik Karolinska (MDK). GMCK ansvarar för att tillhandahålla storskaliga och avancerade genomikanalyser till samtliga laboratoriemedicinska specialiteter inom MDK. Vårt uppdrag är att möjliggöra precisionsdiagnostik genom högkvalitativa genetiska analyser med fokus på klinisk relevans och teknisk spetskompetens. I den här rollen blir du en del av vårt tolkningsteam inom solida tumörer. Huvudfokus ligger på att tolka bioinformatiska resultat från storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS) utifrån etablerade standardrutiner (SOP:er). Du sammanställer och kvalitetssäkrar underlagen som sedan lämnas över till patolog för slutgiltig medicinsk bedömning. För rätt person finns det goda möjligheter att på sikt få ett utökat ansvar, samt bidra till vidareutvecklingen av våra tolkningsflöden och rutiner. I rollen kommer du bland annat att: tolka genetiska varianter (SNV, CNV, fusioner m.fl.). samarbeta nära och diskutera resultat med patologer, molekylärbiologer och kliniker. bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av tolkningsflödena. delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde. delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS). Vi söker dig som är noggrann, strukturerad och har hög ansvarskänsla för kliniska leveranser. har en god kommunikativ förmåga och trivs i gränssnittet mellan bioinformatik och medicinsk diagnostik. har ett engagemang för kvalitet och trivs med att samverka i grupp.    Kvalifikationer Krav: Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område. Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS). Erfarenhet av arbete eller forskning inom cancergenomik och/eller cancerbiologi. Mycket goda kunskaper i svenska och engelska, i både tal och skrift (svenska krävs för den dagliga kommunikationen med övrig vårdpersonal). Meriterande: Doktorsexamen (PhD) inom relevant område. Praktisk erfarenhet av varianttolkning och/eller annotering av somatiska varianter inom cancergenomik. Erfarenhet av arbete som sjukhusgenetiker eller biträdande sjukhusgenetiker (eller motsvarande klinisk roll). Erfarenhet av arbete i klinisk sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, eller inom ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189). Erfarenhet av, eller intresse för operativ samordning eller projektledning. Kunskap om klassificeringssystem för somatiska varianter (t.ex. AMP-riktlinjer). God programmeringsförmåga (t.ex. Python) och vana av Linux-miljöer/HPC. Om rekryteringsprocessen Urval och intervjuer kan komma att ske löpande under ansökningstiden. I samband med din ansökan behöver du bifoga CV. Istället för ett personligt brev ber vi dig besvara urvalsfrågor samt kort motivera varför du passar för rollen. Att besvara frågorna är en förutsättning för att din ansökan ska anses komplett. Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska! Inför tillsättning av befattning som innefattar vård av barn och ungdom, kontrolleras den som erbjuds tjänsten mot misstanke- och belastningsregistret. Här kan du läsa mer om rekryteringsprocessen och om vilka kontroller som utförs på Karolinska. Som anställd på Karolinska Universitetssjukhuset kan du komma att krigsplaceras. Läs mer om vad det innebär här. Om du är eller tidigare har varit anställd i Region Stockholm kommer vi att ta interna referenser från din nuvarande eller tidigare chef om du blir aktuell för anställning. För tillsvidaretjänster kan provanställning komma att tillämpas. Om Karolinska Universitetssjukhuset Vi på Karolinska Universitetssjukhuset är stolta över att vi är ett av världens främsta universitetssjukhus. Förutom vårt särskilda ansvar för den högspecialiserade vården i Stockholmsregionen är huvuduppdraget att tillsammans med Karolinska Institutet utbilda framtidens vårdanställda och bedriva världsledande forskning samtidigt som vi fortsätter vårt arbete med att utveckla vården för patientens bästa. Vi arbetar inom en rad olika områden och professioner. Du kan läsa mer om vårt uppdrag inom vård, forskning och utbildning här. Vår vision - Vi ska bota och lindra imorgon det ingen kan bota och lindra idag. Läs gärna mer om oss på karolinska.se och följ oss på sociala medier!

Vill du arbeta i absolut framkant av den molekylära precisionsdiagnostiken? Vi söker bioinformatiker för att stärka den pågående implementeringen av storskalig DNA-sekvensering inom sjukvården.  Du erbjuds En spännande multidisciplinär arbetsmiljö där ditt dagliga arbete gör stor skillnad för ett stort antal patienter Stor möjlighet att utvecklas i din roll och ta dig an nya arbetsuppgifter över tid Möjligheten att arbeta på ett av världens bästa sjukhus med vård i framkant (World's Best Hospitals 2026 - Newsweek Rankings). Självklart får du också ta del av våra generella förmåner som Karolinska Universitetssjukhuset erbjuder dig. Om tjänsten Tjänsten är placerad vid Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), som är en del av Medicinsk diagnostik Karolinska (MDK). GMCK ansvarar för att tillhandahålla storskaliga och avancerade genomikanalyser till samtliga laboratoriemedicinska specialiteter inom MDK. Vårt uppdrag är att möjliggöra precisionsdiagnostik genom högkvalitativa genetiska analyser med fokus på klinisk relevans och teknisk spetskompetens. Du bidrar till arbetet i ett multidisciplinärt team tillsammans med läkare, molekylärbiologer, andra bioinformatiker och mjukvaruutvecklare inom sjukhuset samt med forskningsinfrastrukturen Clinical Genomics vid Science for Life laboratoriet (SciLifeLab) och forskargrupper på Karolinska Institutet.  I rollen kommer du bland annat att: bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av våra bioinformatiska NGS flöden analysera patientprover inom interna och externa forskningsprojekt och kliniska implementationsprojekt. bidra med expertis inom dataanalys i bioinformatiska utvecklingsprojekt. bistå vår våtlabbsenhet med expertis inom dataanalys vid implementering av nya tekniker och metoder. delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde. delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS). Vi söker dig som   är noggrann, strukturerad och har hög ansvarskänsla för kliniska leveranser. har en stark analytisk förmåga och nyfikenhet på nya tekniker inom genomik. har en god kommunikativ förmåga och trivs i gränssnittet mellan bioinformatik och medicinsk diagnostik. har ett engagemang för kvalitet och trivs med att samverka i grupp. Kvalifikationer Krav: Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område. Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS). Goda programmeringskunskaper (t.ex. Python, R) Vana att arbeta i Linuxmiljö Erfarenhet av arbete i HPC-miljö, gärna med SLURM Goda kunskaper inom statistik, analys och testdesign Mycket god förmåga att uttrycka dig på engelska, både muntligt och skriftligt Meriterande: Doktorsexamen (PhD) inom relevant område. Erfarenhet av arbete i klinisk sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, eller inom annan ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189). Erfarenhet av containerteknologier (t.ex. Singularity, Docker) Erfarenhet av automatiserad testning, CI och strukturerad kod Kunskap i versionshantering (Git) Erfarenhet inom utveckling av bioinformatiska analyser med Nextflow eller liknande ramverk för automatisering av beräkningsanalyser Erfarenhet av utveckling och arbete i kvalitetssäkrade miljöer God förståelse för human genomik kopplat till sällsynta diagnoser eller somatiska sjukdomar  Fördjupade kunskaper inom design och validering av breda genetiska paneler. Goda kunskaper i svenska i tal och skrift. Om rekryteringsprocessen Urval och intervjuer kan komma att ske löpande under ansökningstiden. I samband med din ansökan behöver du bifoga CV. Istället för ett personligt brev ber vi dig besvara urvalsfrågor samt kort motivera varför du passar för rollen. Att besvara frågorna är en förutsättning för att din ansökan ska anses komplett. Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska! Inför tillsättning av befattning som innefattar vård av barn och ungdom, kontrolleras den som erbjuds tjänsten mot misstanke- och belastningsregistret. Här kan du läsa mer om rekryteringsprocessen och om vilka kontroller som utförs på Karolinska. Som anställd på Karolinska Universitetssjukhuset kan du komma att krigsplaceras. Läs mer om vad det innebär här. Om du är eller tidigare har varit anställd i Region Stockholm kommer vi att ta interna referenser från din nuvarande eller tidigare chef om du blir aktuell för anställning. För tillsvidaretjänster kan provanställning komma att tillämpas. Om Karolinska Universitetssjukhuset Vi på Karolinska Universitetssjukhuset är stolta över att vi är ett av världens främsta universitetssjukhus. Förutom vårt särskilda ansvar för den högspecialiserade vården i Stockholmsregionen är huvuduppdraget att tillsammans med Karolinska Institutet utbilda framtidens vårdanställda och bedriva världsledande forskning samtidigt som vi fortsätter vårt arbete med att utveckla vården för patientens bästa. Vi arbetar inom en rad olika områden och professioner. Du kan läsa mer om vårt uppdrag inom vård, forskning och utbildning här. Vår vision - Vi ska bota och lindra imorgon det ingen kan bota och lindra idag. Läs gärna mer om oss på karolinska.se och följ oss på sociala medier!

Vill du kombinera data, programmering och Life Science, och samtidigt få chansen att utvecklas inom ett område som kan bidra till framtidens medicinska forskning? I den här rollen får du arbeta med data från proteomikanalyser och lära dig hur data går från laboratoriet till färdig leverans hos kund. Du behöver inte vara expert från start, det viktigaste är att du har en relevant akademisk bakgrund, ett intresse för data och analys samt grundläggande erfarenhet av R. Du kommer att ha erfarna kollegor omkring dig och få möjlighet att bygga vidare på dina kunskaper i en internationell Life Science-miljö. Vi ser fram emot din ansökan! Om tjänsten Olink - En del av Thermo Fisher Scientific har vuxit explosionsartat de senaste åren och har på kort tid gjort avtryck världen över. Deras banbrytande produkter används idag av ledande forskningsinstitut och läkemedelsbolag för att driva fram nästa stora genombrott inom medicin. Med huvudkontor och service-lab i både Uppsala och Boston är Olink en verkligt global aktör inom Life Science. Här utvecklas och används tekniken för att ge ny förståelse för komplexa sjukdomar som cancer, hjärt- och kärlsjukdomar och neurologiska sjukdomar, forskning som på riktigt kan förändra människors liv. Som Junior Data Manager blir du en viktig del av processen som säkerställer att den data som Olink genererar håller hög kvalitet innan den levereras till kunder runt om i världen. I praktiken innebär det att du arbetar med att kontrollera, analysera och kvalitetssäkra data från Olinks proteomikanalyser. Du kommer bland annat att använda R och andra dataanalysverktyg för att identifiera avvikelser, förstå vad som påverkar datan och säkerställa att resultatet är korrekt. Du kommer också att få en inblick i hela dataflödet, från laboratoriet där analyserna genomförs, via datahantering och kvalitetskontroll, till den färdiga leveransen till kund. Rollen passar därför dig som tycker att det är spännande att jobba med data, lösa problem och förstå vad som faktiskt ligger bakom siffrorna. Du arbetar nära både seniora Data Managers/Data Analysts, laboratorieteam och andra interna funktioner. Det innebär att du får mycket möjlighet att ställa frågor, lära dig av andra och successivt ta mer ansvar. Du blir en del av ett team med kollegor med olika bakgrunder och erfarenhetsnivåer. Här finns en kultur där man hjälper varandra och delar med sig av sin kunskap, vilket gör det till en bra miljö för dig som är i början av din karriär. Det här är ett konsultuppdrag vilket innebär att du kommer vara anställd av Academic Work och arbeta som konsult hos Olink. Uppdraget kommer att vara på heltid och förväntas pågå minst fram till årsskiftet. Det finns goda chanser till förlängning, förutsatt att utrymme för det finns och att alla parter är nöjda med samarbetet. Du erbjuds En junior roll där du får utvecklas tillsammans med erfarna kollegor Praktisk erfarenhet av dataanalys, kvalitetssäkring och R Möjlighet att arbeta med data som används inom medicinsk forskning Möjligheten att arbeta i en nytänkande, internationell miljö hos ett bolag som värdesätter mångfald och inkludering Arbete hos en organisation som våra nuvarande konsulter beskriver som en fantastisk arbetsplats Arbetsuppgifter Som Junior Data Manager kommer du bland annat att: Kontrollera och kvalitetssäkra data från Olinks proteomikanalyser Analysera data i R och andra verktyg för att hitta avvikelser och mönster Säkerställa att data är korrekt innan den levereras till kund Utreda och felsöka problem i data tillsammans med mer seniora kollegor Samarbeta med laboratorie- och dataanalysteam för att förstå och lösa eventuella problem Arbeta strukturerat med flera dataflöden och leveranser parallellt Successivt ta mer ansvar för kvalitetskontroll och datahantering Vi söker dig som Har en akademisk utbildning med inriktning mot molekylärbiologi, bioinformatik eller liknande Har ett genuint intresse för dataanalys och problemlösning Har grundläggande erfarenhet av programmering**** i R Har någon erfarenhet av bioinformatik eller dataanalys, exempelvis genom studier, examensarbete eller tidigare arbete Är mycket bekväm med svenska och engelska i både tal och skrift Det är meriterande, men inget krav, om du har Erfarenhet av bioinformatik utöver dina studier Arbetat med datahantering eller dataanalys Laborativ erfarenhet Erfarenhet av SQL Viktigast av allt, din personlighet För den här rollen tror vi att du är nyfiken, analytisk och gillar att förstå hur saker hänger ihop. Du behöver inte kunna allt från början, däremot tror vi att du gillar att lösa problem, vågar ställa frågor och är motiverad att lära dig nya saker. Eftersom du kommer att samarbeta med flera olika team är det också viktigt att du är prestigelös och tycker om att arbeta tillsammans med andra. Kort sagt: vi söker dig som är i början av din karriär och vill bygga erfarenhet inom data, programmering och Life Science. Övrig information Start: Omgående (Max 1 månads uppsägningstid) Omfattning: Heltid, kontorstider Placering: Uppsala Vår rekryteringsprocess Denna rekryteringsprocess hanteras av Academic Work och vår kunds önskemål är att alla frågor rörande tjänsten skickas till Academic Work. Vi tillämpar löpande urval och kommer plocka ner annonsen när tillräckligt många kandidater har nått slutskedet i rekryteringsprocessen. Vid ansökan efterfrågas ett CV. Personligt brev använder vi inte som urvalsmetod och behöver därför inte bifogas. Rekryteringsprocessen innehåller två urvalstest: ett personlighetstest och ett test i kognitiv förmåga. Testerna är ett verktyg för att kunna hitta den kandidat med högst potential för tjänsten samt främja jämlikhet, mångfald och en rättvis rekryteringsprocess.

Are you passionate about transforming complex spatial biology data into actionable insights? Do you thrive in a cross-functional environment bridging experimental and computational teams? Moleculent is looking for an experienced Computational Biology Scientist with Immunology knowledge to drive and evolve our Applications and Fee-for-Service (FFS) initiatives. Join us to contribute to cutting-edge technology that unveils new perspectives on human biology! Moleculent is on an exciting mission to map cell communication at the molecular level in tissue, aiming to unlock radical new insights into human biology. This is a chance to join a focused and dedicated team with extensive experience in building successful life science companies and products. This is a permanent position based in Solna, Stockholm, with the possibility to work remotely. We welcome your application, but please note that interviews will be conducted in August! JOB DESCRIPTION As a Computational Biology Scientist, you will play a key role in driving data analysis workflows for customer and internal validation projects. You will take ownership of project design, biological interpretation, and stakeholder communication, working closely with wet-lab scientists, the Applications Team Lead, and R&D to ensure high-quality, reliable data insights. Key responsibilities: Design and interpret analysis strategies to support application development and pilot studies. Execute image preprocessing, cell segmentation, and spatial metrics extraction using established pipelines. Compile and visualize results into standardized reports for internal use and customer delivery. Collaborate on refining methods, troubleshooting, and prototyping new analysis metrics. Ensure data traceability and compliance with Moleculent's data packaging standards.  QUALIFICATIONS To fit this role well, you should hold an MSc or PhD in computational biology, bioinformatics, image analysis, spatial omics, or a related field. It’s a strong advantage if you have done a postdoc in a relevant field. Fluency in both written and spoken English, along with strong computer skills, is essential. Experience in clearly and effectively presenting data—both in writing and in oral presentations—is a key requirement. Proficiency in Python and spatial single-cell analysis, with the ability to design, execute, and interpret analysis workflows for complex datasets. A solid understanding of immunology is important, as our data closely relates to immune cell populations, marker panels, and tissue-based immune profiling. Experience working directly with customers—whether through pilot studies, fee-for-service delivery, or technical support—is highly valued in this role. Experience working across R&D, product, and commercial functions is a plus. Skilled in summarizing insights for cross-functional teams.  MOLECULENT We believe that our understanding of the molecular basis of human biology, in health and disease will increase radically in the coming ten years. This will lead to a vast improvement in therapies, and diagnostics, and a new, fundamental understanding of our own biology. Moleculent is on a mission to develop technology-enabled products that leverage new insights into the molecular foundation of human biology. https://www.moleculent.com/