Bioinformatiker

National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS; https://nbis.se) är en stor och snabbt växande nationell infrastruktur som främjar forskning inom livsvetenskaperna i Sverige genom att tillhandahålla support, infrastruktur och avancerad utbildning inom bioinformatikområdet. NBIS utgör bioinformatikplattformen på SciLifeLab (https://www.scilifelab.se), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade storskaliga tekniker och kunnande inom biovetenskaperna, och är också den svenska noden i den europeiska infrastrukturen ELIXIR för biologisk information. Nu ska en av våra datastewarder/bioinformatiker vara föräldraledig och vi söker därför, under en tidsbegränsad period, en vikarierande data steward eller bioinformatiker inom vårt team för data management. Teamet arbetar med alla stödja svenska Life Science-forskare med datahantering enligt principerna för öppen vetenskap och FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable). Den person som anställs kommer framför allt arbeta med stöd till medicinsk och klinisk forskning och kommer också att affilieras med NBIS bioinformatikteam för medicinsk och hälsovårdsforskning. Arbetsuppgifter Vi söker dig som vill vara med att möjliggöra life science-forskning i Sverige som är bortom vad som är möjligt att uppnå för enskilda forskare, ett enskilt universitet eller ett enskilt forskningsområde. Du kommer att bidra till nationella forskningsprojekt där hantering av genomik-, transkriptomik- och spatiella proteomikdata är en viktig del. Ett stort fokus kommer att ligga på att genomföra rutiner för användarstöd till forskare för hantering och tillgängliggörande av humangenetisk data. En viktig del i arbetet är också att utbilda forskare i bioinformatikforskning och forskningsdatahantering i Sverige. Kvalifikationskrav Framgångsrika sökande behöver uppfylla följande krav: PhD inom något av följande områden: bioinformatik, molekylärmedicin eller ett närgränsande fält som arbetsgivaren bedömer relevant för tjänsten Postdoktoral erfarenhet av att arbeta med humant omik-data. Mycket god erfarenhet (minst 10 år) av arbete med bioinformatikdata, inkluderande erfarenhet av analys av t.ex. bulk- och singelcell-transkriptomikdata, spatiella proteomikdata samt Illumina och Nanopore helgenoms-, metylerings- och RNAseq-sekvenseringsdata. Dokumenterad erfarenhet av arbete (minst 5 år) med inflammatoriska och infektionssjukdomar Erfarenhet (minst 5 år) av att, på internationellt konkurrenskraftig nivå, självständigt driva supportprojekt. Erfarenhet (minst 5 år) av att arbeta i en nationell infrastruktur för bioinformatikstöd God förmåga i ett skriptspråk såsom R eller Python, samt att arbeta effektivt i Linux kommandoradsmiljö och på storskaliga datorkluster. Mycket god förmåga att kommunicera på engelska, både i tal och skrift, samt kommunicera med forskare med olika bakgrunder. Mycket god erfarenhet att samarbeta och arbeta i en serviceintriktad organisation. Erfarenhet av undervisning. Vilja att lära sig nya metoder och ha en förmåga att utveckla nya färdigheter. Hänsyn kommer också ges till god samarbetsförmåga, driv, självständighet och personlig mognad, samt hur bra sökandes erfarenhet och färdigheter kompletterar och stärker NBIS verksamhet. Önskvärt/meriterande i övrigt Erfarenhet av internationella repositorier för deponering och publicering av Life Science-data är meriterande. Mycket god erfarenhet av arbete med avancerade bioinformatikanalyser, inkluderande pre-processning och statistiska analyser, selektion och visualisering, och genetiska associationsstudier är en stark merit. Kunskapsöverföring är ett annat viktigt koncept för oss och handledarerfarenhet är starkt meriterande. Erfarenhet av arbete med autoimmuna sjukdomar är ytterligare meriterande. ”Reproducerbar forskning” och ”FAIR data” är centrala koncept för oss och erfarenhet av relevanta verktyg och metoder är meriterande. Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad, vikariat 7 månader med möjlighet till eventuell förlängning. Omfattningen är heltid. Tillträde 2026-08-17 ellerenligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Bengt Persson, [email protected] Ansökan ska innehålla CV med referenser och ett personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Välkommen med din ansökan senast den 30 juni 2026, UFV-PA 2026/2134. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem. Fackliga företrädare: Saco-S - [email protected], Seko - [email protected], ST (OFR/S) - [email protected]

Institutionen för biokemi och biofysik. SciLifeLab (SciLifeLab) är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. SciLifelab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med flera andra lärosäten.  Administrativt kommer anställningen att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet. För mer information om vår verksamhet, se vår webbplats: www.dbb.su.se. Arbetsuppgifter SciLifeLab och Wallenberg National Program for Data-Driven Life Science (DDLS) är ett 12-årigt initiativ som fokuserar på datadriven forskning, med syftet att utbilda och rekrytera nästa generation av livsvetare samt skapa stark och globalt konkurrenskraftig kompetens inom beräkningsvetenskap och datavetenskap för svensk livsvetenskap. Programmet syftar till att stärka nationella samarbeten mellan universitet, överbrygga forskningsmiljöerna inom livs- och datavetenskap samt skapa partnerskap med industri, hälso- och sjukvård och andra nationella och internationella aktörer. Vi söker nu en Data Science Lead till SciLifeLabs bioinformatikplattform (National Bioinformatics Infrastructure Sweden: www.nbis.se) för att bidra till att forma och påskynda införandet av avancerad maskininlärning och AI inom datadriven livsvetenskaplig forskning. Vid SciLifeLabs bioinformatikplattform (NBIS), en unik nationell infrastruktur med över 120 experter, kommer du att ha en nyckelroll i strategisk och praktisk planering tillsammans med SciLifeLabs AI Lead och andra nationella och internationella partners. En del av din tid kommer också att innebära att bidra till utvalda forskningsprojekt, ge vägledning kring avancerade analytiska och AI-drivna metoder samt medverka i forskarutbildning på nationell nivå. De huvudsakliga arbetsuppgifterna är: Strategisk och praktisk planering för att forma och påskynda införandet av avancerad maskininlärning och AI inom datadriven livsvetenskaplig forskning, i nära samarbete med centrala nationella och internationella partners. Medverka i vetenskaplig vägledning och utbildning av senior bioinformatikpersonal inom stödverksamhet. Genomföra avancerade dataanalyser och ge vägledning i nationellt prioriterade datadrivna forskningsprojekt inom livsvetenskap. Medverka i avancerade nationella forskarutbildningskurser och utbildningsinsatser. Kvalifikationer Vi söker dig som har: doktorsexamen eller motsvarande arbetslivserfarenhet inom bildanalys, bioinformatik, datavetenskap, ingenjörsvetenskap, fysik eller motsvarande område. omfattande erfarenhet (5+ år) av att tillämpa och/eller utveckla avancerade metoder inom maskininlärning och AI i internationellt konkurrenskraftig livsvetenskaplig forskning. mycket god muntlig och skriftlig kommunikationsförmåga på engelska. stark samarbets- och kommunikationsförmåga. Ytterligare kvalifikationer Relevant postdoktoral erfarenhet eller motsvarande erfarenhet från industrin är en stark merit men inget krav. Programmeringskunskaper i Python och erfarenhet av datavetenskapliga verktyg såsom Numpy, Pandas eller Matplotlib är meriterande, liksom erfarenhet av att använda moderna deep learning-ramverk såsom PyTorch och TensorFlow, eller avancerad användning av LLM:er. “Reproducerbar forskning” och “FAIR-data” är centrala begrepp för oss, och vi värdesätter erfarenhet av utveckling av reproducerbar kod genom plattformar för koddelning, versionshantering, arbetsflödesspråk och containerlösningar. Dokumenterad förmåga att ansvarsfullt och rättsenligt tillämpa maskininlärnings-och AI-metoder på känsliga personuppgifter är meriterande, liksom erfarenhet av validering och tolkning av AI-modeller. Om anställningen Anställningen gäller tills vidare på heltid med sex månaders provanställning. Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning. Tillträde enligt överenskommelse. Vi erbjuder Hos oss får du dynamiken i samspelet mellan högre utbildning och forskning som gör Stockholms universitet till en spännande och kreativ miljö. Du arbetar i en internationell miljö och får förmånliga villkor. Arbetsplatsen är förlagd till SciLifeLab’s Stockholm campus i Solna. Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla. Kontakt Ytterligare information lämnas av Björn Nystedt, [email protected] eller Pär Engström, [email protected]. Ansökan Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag. Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning. Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.

Institutionen för biokemi och biofysik. SciLifeLab (SciLifeLab) är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. SciLifelab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med flera andra lärosäten.  Administrativt kommer anställningen att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet. För mer information om vår verksamhet, se vår webbplats: www.dbb.su.se. Arbetsuppgifter SciLifeLab och Wallenberg National Program for Data-Driven Life Science (DDLS) är ett 12-årigt initiativ som fokuserar på datadriven forskning, med syftet att utbilda och rekrytera nästa generation av livsvetare samt skapa stark och globalt konkurrenskraftig kompetens inom beräkningsvetenskap och datavetenskap för svensk livsvetenskap. Programmet syftar till att stärka nationella samarbeten mellan universitet, överbrygga forskningsmiljöerna inom livs- och datavetenskap samt skapa partnerskap med industri, hälso- och sjukvård och andra nationella och internationella aktörer. Vi söker nu framstående experter inom datavetenskap, maskininlärning och artificiell intelligens för att stödja excellenta forskningsprojekt samt medverka i avancerad handledning och forskarutbildning på nationell nivå. Som en del av våra nationella stödteam blir du en fullt integrerad medlem av SciLifeLabs bioinformatikplattform (National Bioinformatics Infrastructure Sweden: www.nbis.se), en unik nationell infrastruktur med över 120 experter som erbjuder avancerat stöd, infrastruktur och utbildning inom bioinformatik och datavetenskap till det svenska livsvetenskapliga forskarsamhället, med ett starkt nationellt och internationellt samarbetsnätverk. De huvudsakliga arbetsuppgifterna är att: Genomföra avancerade dataanalyser inom nationellt prioriterade datadrivna forskningsprojekt inom livsvetenskap, med fokus på avancerad maskininlärning och AI. Utveckla och implementera nödvändiga verktyg och arbetsflöden för sådana analyser. Utbilda andra forskare runt om i Sverige genom samverkan inom projektstöd, konsultationer, mentorskap och avancerade nationella forskarutbildningskurser. Medverka i den strategiska utvecklingen av avancerad maskininlärning och AI vid bioinformatikplattformen, inom DDLS-programmet och inom SciLifeLab som helhet, i nära samarbete med externa partners. Kvalifikationer Vi söker framstående experter inom maskininlärning och AI med erfarenhet inom områden som avancerad bildanalys, datastrukturering och dataintegration samt stora språkmodeller (LLM:er) med tillämpningar inom biologisk och biomedicinsk forskning. De framgångsrika kandidaterna ska ha: doktorsexamen eller motsvarande arbetslivserfarenhet inom bildanalys, bioinformatik, datavetenskap, ingenjörsvetenskap, fysik eller motsvarande. omfattande erfarenhet (3+ år) av att tillämpa och/eller utveckla avancerade metoder inom maskininlärning och AI med relevans för internationellt konkurrenskraftig livsvetenskaplig forskning. mycket god muntlig och skriftlig kommunikationsförmåga på engelska. stark samarbets- och kommunikationsförmåga.  Ytterligare kvalifikationer Relevanta postdoktorala studier eller motsvarande erfarenhet från industrin är en stark merit men inget krav. Programmeringskunskaper i Python samt erfarenhet av data science-verktyg såsom NumPy, Pandas eller Matplotlib är meriterande, liksom erfarenhet av moderna deep learning-ramverk såsom PyTorch och TensorFlow. ”Reproducerbar forskning” och ”FAIR-data” är centrala begrepp för oss, och vi värdesätter erfarenhet av utveckling av reproducerbar kod genom plattformar för koddelning, versionshantering, workflowspråk och containerlösningar. Dokumenterad förmåga att ansvarsfullt och i enlighet med lagar och regler använda maskininlärnings-/AI-metoder för känsliga personuppgifter är meriterande, liksom erfarenhet av validering och/eller tolkningsbarhet av AI-modeller. Om anställningen Anställningen gäller tills vidare på heltid med sex månaders provanställning. Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning. Tillträde enligt överenskommelse. Vi erbjuder Hos oss får du dynamiken i samspelet mellan högre utbildning och forskning som gör Stockholms universitet till en spännande och kreativ miljö. Du arbetar i en internationell miljö och får förmånliga villkor. Arbetsplatsen är förlagd till SciLifeLab’s Stockholm campus i Solna. Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla. Kontakt Ytterligare information lämnas av Björn Nystedt, [email protected] eller Pär Engström, [email protected]. Ansökan Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag. Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning. Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 46 000 studenter och 8 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor. Beskrivning av arbetsplatsenSciLifeLab (www.scilifelab.se), som grundades 2010, är ett nav för life science-forskning i Sverige och ett samarbete mellan svenska universitet.  Den anställde kommer att arbeta vid SciLifeLab Data Centre (DC), som ansvarar för IT-frågor och forskningsdatahantering för SciLifeLabs teknologiplattformar och andra SciLifeLab-organiserade program och aktiviteter, bl.a. det nationella forskningsprogrammet för datadriven livsvetenskap (DDLS). Vi har ett nationellt uppdrag och driver tjänster för livsvetenskapliga data och e-infrastruktur, men även frågor om FAIR, öppen vetenskap och datadriven forskning, i stark samverkan med nationella och internationella aktörer. Hos oss har du möjlighet att aktivt påverka hur IT integreras i framtidens hälso- och miljöforskning, och arbeta för öppenhet, reproducerbarhet och största möjliga vetenskapliga genomslag för de stora mängder forskningsdata som genereras i fältet. Du kommer att arbeta med forskare, dataingenjörer, data stewards, och systemutvecklare i ett snabbt växande, dynamiskt och progressivt team med en ledande roll i landet. Anställningen är placerad vid Lunds universitet, inom SciLifeLab Lunds organisatoriska enhet med rapportering i linjen direkt till dess föreståndare. Arbetet leds av föreståndaren för SciLifeLab Data Centre. Arbetsuppgifter och ansvarsområdenSciLifeLab Data Centre (DC) söker en chef för vårt verksamhetsområde för vetenskapliga datatjänster. Området anställer idag ca 20 systemutvecklare och dataingenjörer med placering vid ett flertal av våra partneruniversitet, som fokuserar på utveckling, drift och support av datatjänster med vetenskapligt och bioinformatiskt innehåll, t.ex. för AI-modeller och beräkningsapplikationer, FAIR delning av forskningsdata för infektionssjukdomar, biodiversitet, bilddata, cell- och molekylärbiologi etc. Tjänsterna utvecklas baserat på behov från SciLifeLabs användare och som en del av SciLifeLab Data Centres uppdrag som digital infrastruktur. Arbetet vänder sig mot användare inom nationell infrastruktur såväl som vid programmet för Data-Driven Life Science (DDLS) och svenska life science-forskare i allmänhet. Ett fokus för kommande år är att bygga upp gemensamma integrativa tjänster för multimodala data genererade vid SciLifeLabs infrastrukturplattformar. Som chef för området kommer du att ansvara för personal- och ekonomifrågor för verksamhetsområdet, ingå i vår ledningsgrupp, och samordna arbetet inom området med andra verksamhetsområden vid DC. Detta inkluderar t.ex. områden för forskningsdatahantering, IT och tjänsteförvaltning. Du kommer även att ha en nyckelroll för DC’s strategiska arbete inom SciLifeLab för digital infrastruktur, och inom vårt samverkansarbete gentemot universitetsförvaltning, andra nationella infrastrukturer (t.ex. NAISS, SUNET och SND) samt internationella partners (t.ex. EMBL, CSC, CERN och VIB). DC har en starkt forskningsdriven verksamhet och du kommer särskilt att utveckla denna del hos oss. Du förväntas ha lång och internationell erfarenhet som chef och forskare vid infrastrukturer för bioinformatik och life science, och kunna ta en aktiv och drivande roll för att utveckla och leda verksamhet och organisation inom DC. Du behöver ha en stark egen erfarenhet som forskare. En hög förmåga till samverkan och kommunikation krävs både som en del av ledningen, gentemot samarbetspartners, och mot användargrupper. Placering är vid Lunds Universitet, och du kommer att särskilt utveckla DC’s nationella samverkan i Lund och södra Sverige, men din roll är ett tydligt nationellt uppdrag som chef och kräver god närvaro och förmåga att leda en nationellt distribuerad verksamhet. Kvalifikationer Krav för tjänsten: Du ska ha doktorsexamen inom relevant ämne, och minst tio års erfarenhet som chef med personal- och budgetansvar och strategiarbete vid internationell infrastruktur inom life science eller bioinformatik.  Dokumenterad flerårig erfarenhet av egen forskning inom life science/bioinformatik Dokumenterad erfarenhet av storskalig datahantering, högpresterande beräkningssystem (HPC), GPU-acceleration samt parallella filsystem Dokumenterad erfarenhet att leda personal och verksamhet för bioinformatikstöd och utveckling av bioinformatiska tjänster och verktyg Dokumenterad erfarenhet att säkra konkurrenssatt finansiering för egna projekt, samt driva dessa som PI Dokumenterad erfarenhet av träning och utbildning av forskare och teknisk personal inom life science Dokumenterad erfarenhet i egen roll som systemutvecklare med erfarenhet av teknologier för containerisering, t.ex Docker Mycket god förmåga att kommunicera obehindrat på engelska, i tal och skrift Önskvärt/meriterande i övrigt Kunskap om eller intresse för svensk biomedicinsk forskning och infrastruktur Erfarenhet av att arbeta med Scrum eller liknande agila metoder Erfarenhet av strategiutveckling för digital infrastruktur Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet. Den sökande ska ha mycket god samarbetsförmåga, initiativförmåga och goda kommunikativa kvaliteter, samt kunna visa aktiv kompetensutveckling relevant för arbetsbeskrivningen. Som person bör du vara flexibel, kreativ och serviceinriktad. Du bör även vara kvalitetsmedveten samt mål- och resultatinriktad. Övrigt Anställningen är tillsvidare på heltid med önskat tillträde den 2026-09-01 eller enligt överenskommelse. Provanställning under 6 månader kan komma att tillämpas. Så här söker du Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter.Ansökan ska även innehålla CV eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av examensbevis.)   Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.